Извършването на финансова инспекция на КФН от страна на изпълнителната власт представлява сериозна намеса в дейността на независим орган, който се избира, отчита и контролира от Народното събрание. Това нарушава независимостта на комисията като орган, осъществяващ надзор в небанковия финансов сектор и представляващ интегрална част от системата на европейските регулаторни органи. Това се посочва в становище на председателя на КФН Стоян Мавродиев за започналата проверка на Агенцията за държавна финансова инспекция на регулатора по повод писмо от 19 януари 2012 г. от финансовия министър Симеон Дянков. Предприемането на всякакви действия от страна на органи на изпълнителната власт и/или трети лица би представлявало пренебрегване на независимия статут на комисията, съответно сериозно нарушение на европейски нормативни актове и би предпоставило стартирането на съдебни дела пред компетентния европейски съд и наказателни процедури срещу страната ни, категоричен е Мавродиев. Той счита заповедта за незаконосъобразна и в нарушение на заложения в конституцията принцип за разделение на властите.